在国家需求方面：针对国家在气候预测、海洋防灾减灾、海洋环境保护、资源安全可持续开发利用、及国防安全和海洋权益等方面的迫切需求，开展海洋环流和波动方面的基础和应用科学研究，为国家经济、社会发展和国防安全做出重大贡献；

    在学科国际前沿方面：积极策划发起、组织和参与国际前沿研究计划，结合自身的优势和特点，集中研究海洋动力过程与变异规律，以及与全球变化有关的海洋动力学问题，取得国际上有显示度的学术成果，确立本实验室在国际上的学术地位；

    在海洋所的发展方面：本实验室由物理海洋学研究室(1957年成立)和海洋环流与海气相互作用研究实验室(1989年成立)2006年合并成立的中国科学院海洋研究所海洋环流与波动开放研究实验室基础上，于2006年被批准筹建院重点实验室，2008年正式批准为院重点实验室。实验室具有60多年的发展历史，一直是中国科学院海洋研究所的一个重要优势学科，为我国物理海洋科学，特别是海洋环流的发展做出了许多开创性的贡献。在海洋所“一三五”发展规划中，本实验室担负着实现重大突破3“热带西太平洋环流变异及其对气候、环境的影响”的重任，对海洋所其他学科的发展具有不可或缺的重要支撑作用，是海洋所发展的主力军。